南通支雲前身是2014年成立的廣西龍桂達。2015年12月31日，俱樂部變更工商注冊，北遷江蘇省南通市，並更名為南通支雲足球俱樂部。2018年10月27日，在中國足球乙級聯賽半決賽中，南通支雲以總比分1-0擊敗陝西大秦之水，成功打進決賽，並成功升入中甲聯賽。
球隊現任主帥為40歲的曹睿，曾擔任過江蘇隊的助理教練，在上賽季接替謝暉成為了球隊主教練。
南通支雲在上賽季的中甲聯賽中以20勝5平9負的戰績位列中甲第五，本賽季是被看好衝超的隊伍之一。
南通支雲在外援方麵保留了上賽季的科雷亞和特拉奧雷，本賽季將以雙外援的配置征戰中甲聯賽。
在內援方麵，球隊簽下了艾孜麥提、鞏漢魁、雷文傑、王傑、李亮亮、魏來、趙舒豪等球員，此外還提拔了葉道馳、薛天和李俊駒等年輕球員進入一線隊。
南通支雲最近6次和蘇州東吳的比賽中取得了4勝2平的不敗戰績，占據絕對優勢。